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Esta teoria é bastante aceita hoje e encontra vários pontos de sustentação. Com o seqüenciamento do DNA de cloroplastos, mitocôndrias e algumas bactérias, viu-se que o DNA de cada uma destas organelas é muito mais parecido com o DNA das bactérias do que com o DNA das células hospedeiras, mostrando a existência de ancestrais recentes. Existem até estudos mostrando que a estrutura de determinadas bactérias é realmente muito parecida com a dos cloroplastos e das mitocôndrias.
É possível encarar a relação de cloroplastos mitocôndrias com organismos eucariontes como um mutualismo, já que sem eles as células eucariontes são incapazes de respirar ou produzir energia. Em contrapartida, cloroplastos e mitocôndrias encontram nas células eucariontes um ambiente ideal para viver, desenvolver-se e reproduzir-se.
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